Pour supprimer un compte utilisateur, on doit d'abord supprimer tous ses fichiers, boîtes aux lettres, alias courrier, tâches d'impression, tâches at et cron, ainsi que toutes les autres références à cet utilisateur. Puis, on supprime les lignes adéquates dans /etc/passwd et /etc/group (ne pas oublier de supprimer le username de tous les groupes auxquels il a été ajouté). Il est préférable de d'abord désactiver le compte (voir plus bas) avant de commencer à tout supprimer afin d'éviter que l'utilisateur utilise le compte pendant qu'il est en train d'être détruit.
Les utilisateurs pouvant avoir plusieurs fichiers se trouvant en dehors de
leur répertoire d'acceuil, ceux-ci peuvent être trouvés en utilisant la
commande find :
Cependant, la commande ci-dessus mettra beaucoup de temps à
s'exécuter si l'on a de gros disques. Si l'on monte des disques en réseau
(voir la section 1.3.8), on doit être prudent afin de ne pas planter
le réseau ou le serveur.
Certaines distributions Linux disposent de commandes spéciales pour cette opération : elles s'appellent généralement deluser ou userdel. Il est, de toutes façons, facile de réaliser cela manuellement, et les commandes ne peuvent tout faire.