Redémarrer signifie démarrer à nouveau le système. Ceci peut être réalisé en l'arrêtant d'abord complètement, en l'éteignant puis en le rallumant. Une façon plus simple est de demander à shutdown de relancer le système, au lieu de simplement l'arrêter. Ceci est réalisé en utilisant l'option -r de shutdown, par exemple en tapant la commande shutdown -r now. La plupart des systèmes Linux lancent shutdown -r now lorsque la combinaison de touches ctrl-alt-suppr est tapée au clavier. Ceci relance le système. Cependant, l'action liée à ctrl-alt-suppr est reconfigurable, et il peut être préférable de donner un certain délai avant le redémarrage sur une machine multi-utilisateurs. Les systèmes physiquement accessibles par n'importe qui peuvent même être configurés pour ne rien faire avec la combinaison ctrl-alt-suppr.