Le système de fichiers racine devrait normalement être petit, puisqu'il contient beaucoup de fichiers très importants et qu'un petit système de fichiers, peu souvent modifié, a de moins de risques d'être endommagé en cas de crash. Un système de fichiers racine endommagé signifie souvent un système non démarrable sauf à employer des mesures spéciales (par exemple, en démarrant à partir d'une disquette), situations que l'on désire éviter.
Le répertoire racine ne contient généralement aucun fichier, à part
peut-être l'image boot standard du système, souvent appelée /vmlinuz.
Tous les autres fichiers sont dans les répertoires du système de fichiers
racine :